바이오인포매틱스 ESTs 서열분석

제1장 개요 = 9
1. 포스트 지놈 = 9
1) 서열 데이터와 정보 = 12
2) 유전정보의 흐름 = 13
3) 유전자 발현(gene expression) = 14
2. ESTs란 무엇인가? ; From cDNA to ESTs = 18
1) 유전체 연구 프로젝트와 ESTs = 19
2) 유전자 탐색과 지도 작성의 핵심 도구 EST = 21
3) ESTs와 유전자 발견 = 23
3. ESTs Clustering의 필요성 = 24
제2장 ESTs 데이터 분석의 실전 = 29
1. 염기서열 분석의 가장 대표적인 소프트웨어 Phred／Phrap = 30
1) Phred Algorithm = 32
2) Phred의 Quality Score = 33
3) Phred의 사용 = 34
2. RepeatMasker를 이용한 박복 서열 영역 확인 = 53
3. ICAtools를 이용한 ESTs Clustering = 67
4. ESTs 데이터베이스를 이용한 새로운 유전자 탐색 = 77
5. BLAST를 이용한 서열 상동성 검색 = 80
6. CCBB BLAST 검색 서버의 이용 = 95
7. CAP3를 이용한 ESTs 서열배열(sequence assembly) = 104
부록 1-1. 예제 소스 = 117
부록 1-2. 예제 소스 = 123
부록 1-3. 예제 소스 = 128
부록 2 = 135
부록 3 = 143
용어 정리 = 155
찾아보기 = 161