유전체 데이터 분석

Part 1. 생명의 정보학 Bioinformatics for Life
Chapter 1 생명의 정보학 3 Bioinformatics for Life

Part 2. 마이크로어레이 데이터와 유전체 발현 분석 advanced Microarray Data Analysis
Chapter 2 마이크로어레이 데이터와 유전체 발현 분석의 이해 17 advanced Microarray Data Analysis
Chapter 3 유전체 발현 데이터 분석 실습 33 Gene Expression Data Analysis
Chapter 4 유전자 온톨로지와 생물학적 패스웨이 지식의 활용 59 Gene Ontology and Biological Pathway-based Analysis
Chapter 5 유전자집합 분석과 예후아군의 예측 73 Gene Set Approaches and Prognostic Subgroup Prediction

Part. 3 차세대 염기서열 데이터 분석 Next Generation Sequencing, Useful Applications
Chapter 6 차세대 염기서열 데이터 분석의 이해와 응용 97 Next Generation Sequencing Data Analysis
Chapter 7 차세대 시퀀싱 플랫폼과 기초 데이터 분석 113 NGS Platforms and Basic Data Analysis
Chapter 8 서열 변이 주석달기와 엑솜 데이터 분 석131 Sequence Variant Annotation and Exom Data Analysis
Chapter 9 RNA-Seq 데이터 분석 155 RNA-Seq Data Analysis

Part. 4 네트워크 생물학과 서열 모티프 및 패스웨이, 온톨로지 분석 Network Biology, Sequence, Pathway and Ontology Informatics
Chapter 10 생명 네트워크와 서열 모티프, 패스웨이 및 온톨로지 171 Biological Networks, Motifs, Pathways and Ontologies
Chapter 11 서열 모티프 및 계통수 분석과 시각화 185 Analysis and Visualization of Sequence Patterns and Similarities
Chapter 12 생체경로, 유전자 온톨로지, 텍스트 마이닝 211 Pathway Analysis, Gene Ontology Analysis and Biological Text Mining
Chapter 13 생물학적 네트워크 분석 233 Biological Network Analysis

Part. 5 인간유전체 다형성 및 유전체 변이 데이터 분석 SNPs, GWAS and CNVs, Informatics for Genomic Variants
Chapter 14 인간유전체 다형성 및 유전체 변이 데이터 분석 249 SNPs, GWAS, CNVs: Informatics for Human Genome Variations
Chapter 15 SNP와 약물유전체 데이터베이스 활용 263 SNP Data Analysis
Chapter 16 전장유전체 연관분석 실습 283 GWAS Data Analysis
Chapter 17 복제수변이 데이터 분석 297 CNV Data Analysis

Part. 6 메타유전체 및 후성유전체 데이터 분석 Metagenome and Epigenome, Basic Data Analysis
Chapter 18 메타유전체와 후성유전체 데이터 분석의 이해 313 Metagenome and Epigenome Data Analysis
Chapter 19 메타유전체 데이터 분석 323 Metagenome Data Analysis
Chapter 20 후성유전체 데이터베이스와 분석 도구 341 Epigenome Database and Analysis Tools
Chapter 21 후성유전체 데이터 분석 353 Epigenome Data Analysis

Appendix A R을 이용한 기초 데이터 분석 연습 367
Appendix B 유전체 데이터 분석에 사용되는 응용 프로그램 설치 안내서 395

글을 마치며 415