최신 임상진단 미생물학 : 이론과 실제

1부 기초 임상미생물학 1

1장 기초 임상미생물학
◈ 개요 4
I. 인체의 정상균무리 5
Ⅱ. 미생물의 병원성 5
Ⅲ. 감염병의 발생과 현재의 과제 9
Ⅳ. 미생물의 분류 11
1. 미생물의 명명 12
2. 세균의 분류 12
V. 미생물의 유전자 전달과 재조합 17
세균 간의 유전물질 전달 17
Ⅵ. 원핵세포와 진핵세포 21
Ⅶ. 의학적으로 중요한 세균 22
단원 요약 24
단원 핵심 문제 25

2장 임상미생물 실험실의 생물학적 안전 관리
◈ 개요 30
I. 생물학적 안전 규정 및 지침 30
Ⅱ. 일반적인 실험실 안전 관리 31
Ⅲ. 개인보호구의 착용 31
개인보호구 31
Ⅳ. 클린벤치와 생물학적 안전상자 35
1. 클린벤치(clean bench)의 종류와 기능 35
2. 생물학적 안전상자(biological safety cabinet, BSC)의 종류와 기능 36
V. 생물학적 안전등급 37
1. 생물학적 안전등급 1등급 (biological safety level 1, BSL-1) 37
2. 생물학적 안전등급 2등급 (biological safety level 2, BSL-2) 38
3. 생물학적 안전등급 3등급 (biological safety level 3, BSL-3) 39
4. 생물학적 안전등급 4등급 (biological safety level 4, BSL-4) 39
5. 생물학적 안전 등급에 따른 미생물의 분류(KDCA) 39
6. 국가관리가 필요한 병원성 미생물(KDCA) 46
Ⅵ. 임상미생물 실험실의 특수 감염 관리 47
1. 화학물질의 안전성 47
2. 병원균 검체의 운송 47
단원 요약 53
단원 핵심 문제 53

3장 임상미생물 동정을 위한 기초 실험
◈ 개요 58
Ⅰ. 현미경적 형태 관찰 60
1. 광학현미경의 종류 60
2. 전자현미경 64
Ⅱ. 임상미생물의 동정과정 66
1. 검체의 수집 66
2. 현미경 관찰을 위한 시료 준비 68
3. 염료와 염색의 원리 68
4. 미생물의 배양 72
단원 요약 84
단원 핵심 문제 85

4장 항미생물 치료와 항생제 감수성 시험
◈ 개요 90
I. 항미생물 치료의 원칙 90
Ⅱ. 항미생물제의 일반적 특성 90
Ⅲ. 항생제의 병용요법 94
1. 항생제의 병용작용 효과 94
2. 항미생물제에 영향을 미치는 요인 95
Ⅳ. 항미생물제의 내성 획득 96
1. 항미생물제의 내성 기전 97
2. 생물막과 항미생물제 내성 101
V. 항미생물 치료의 새로운 접근 101
1. 세균 이온 순환능의 표적화 101
2. 세균의 유전적 제어의 표적화 101
3. 생균제와 프리바이오틱 치료 101
4. 란티바이오틱 치료 102
5. 박테리오파지를 이용한 치료 102
6. 내성균 확산 방지를 위한 제언 102
Ⅵ. 항균제 감수성 시험 102
1. 디스크 확산법 103
2. 희석법 110
3. 자동화장비를 이용한 항생제 감수성시험 114
Ⅶ. 다제내성 의료관련 감염균의 검사실 진단법 117
1. 반코마이신 내성 황색포도알균(VRSA) 117
2. 메티실린 내성 황색포도알균 119
3. 반코마이신 내성 장알균 121
4. 카바페넴 내성 장내세균 122
Ⅷ. Extended-spectrum 베타-락탐분해효소(ESBL)
검출시험 127
1. 배경 및 원리 127
2. ESBL 확진시험 127
3. ESBL 검출이 어려운 균종 129
4. ESBL 검출 보고방법 129
단원 요약 130
단원 핵심 문제 131

2부 임상세균학 133

5장 그람양성 알균
◈ 개요 136
Ⅰ. 마이크로코쿠스(Micrococcus )속 136
Micrococcus 속의 일반적 특성 136
Ⅱ. 포도알균(Staphylococcus )속 137
1. 분류 137
2. 포도알균속의 동정 시험 142
5-1 단원 요약 147
5-1 단원 핵심 문제 148
Ⅲ. 사슬알균(Streptococcus )속 150
1. 분류 150
2. 그룹 A β-용혈성 사슬알균(S. pyogenes ) 151
3. 그룹 B β-용혈성 사슬알균(S. agalactiae ) 154
4. 기타 β-용혈성 사슬알균 154
5. β-용혈성 사슬알균의 동정 시험 154
6. 폐렴사슬알균 158
7. 폐렴사슬알균의 동정 시험 159
8. Viridans 그룹 사슬알균 161
9. S. milleri 162
Ⅳ. 창자(장)알균(Enterococcus)속 163
1. 특징 및 감염경로 163
2. 병원성 163
3. 예방 및 감염 관리 163
4. 창자(장)알균의 동정 시험 163
5-2 단원 요약 168
5-2 단원 핵심 문제 169

6장 산소성 조건무산소성 그람양성 막대균과 항산성 세균
◈ 개요 174
Ⅰ. 아포형성 산소성 그람양성 막대균 174
Bacillus 속 174
6-1 단원 요약 180
6-1 단원 핵심 문제 181
Ⅱ. 아포 비형성 조건무산소성 그람양성 막대균 182
1. Corynebacterium 속 182
2. 기타 Corynebacteria 187
6-2 단원 요약 187
6-2 단원 핵심 문제 188
3. Listeria monocytogenes 189
4. Erysipelothrix 속 191
5. Nocardia 속 192
6. Actinomyces 속 192
7. Rhodococcus 속 194
8. Tropheryma whippeli 194
6-3 단원 요약 194
6-3 단원 핵심 문제 194
Ⅲ. 항산성 세균 196
1. 개요 196
2. M ycobacterium tuberculosis와 Mycobacterium bovis 196
3. Mycobacterium leprae 207
4. 비정형 미코박테리아 208
6-4 단원 요약 210
6-4 단원 핵심 문제 210

7장 그람음성 알균
◈ 개요 214
Ⅰ. Neisseria gonorrhoeae (임균) 214
1. 특징 및 감염경로 214
2. 병원성 215
3. 치료 및 예방 216
4. 검사실 동정 시험 216
Ⅱ. Neisseria meningitidis (수막염균) 221
1. 특징 및 감염경로 221
2. 병원성 222
3. 예방 222
4. 치료 223
5. 검사실 동정 시험 223
Ⅲ. Moraxella catarrhalis 226
1. 특징 및 감염경로 226
2. 병원성 226
3. 치료 226
4. 검사실 동정 시험 227
Ⅵ. 기타 그람음성 알균 227
단원 요약 228
단원 핵심 문제 229

8장 그람음성 막대균, 장내세균목(Enterobacterales)
◈ 개요 232
Ⅰ. 장내세균의 일반적 특징 235
Ⅱ. 장내세균 검출을 위한 검체 236
1. 대변 236
2. 혈액 237
3. 검체의 수송 및 보관 237
4. 검체 처리 238
Ⅲ. 장내세균의 분리배양을 위한 배지 238
1. 대변배양용 증균배지와 배양의 기본원칙 238
2. 증균배지 239
3. 감별배지 및 선택배지 240
Ⅳ. 장내세균의 생화학적 동정 시험 247
1. Oxidase 시험 247
2. O-F(Oxidation or Fermentation) 시험 248
3. IMViC 시험 249
4. 질산염환원 시험 253
5. Lysine, Arginine, Ornithine decarboxylase test(탈탄산효소시험) 253
6. H2S 생성능 시험(TSI, KIA 배지) 255
7. Lysine iron agar 257
8. ONPG(Ortho-Nitro Phenyl Galactoside) 시험 257
9. Penylalanine deaminase test
(Penylalanine 탈아민효소시험) 258
10. Urease 생성시험 259
Ⅴ. 상업화된 kit API 20E system에 의한 동정 260
1. 원리 260
2. 재료 및 시약 260
3. 정도 관리(Quality control) 261
4. 방법 261
5. 결과의 판독 261
6. Website에서 찾는 방법 261
Ⅵ. 젖당 발효 장내세균 265
1. Escherichia 속 266
2. Klebsiella 속 269
3. Enterobacter 속 271
4. Serratia 속 271
5. Citrobacter 속 273
Ⅶ. 젖당 비발효 장내세균 274
1. Salmonella 속 274
2. Shigella 속 283
3. Proteus 속 289
4. Morganella 속 291
5. Providencia 속 291
6. Yersinia 속 292
Ⅷ. 기타 장내세균 299
1. Plesiomonas 속 299
2. Erwinia 속 299
3. Edwardsiella 속 300
4. Ewingella 속 300
5. Hafnia 속 300
단원 요약 302
단원 핵심 문제 306

9장 포도당 비발효 산소성 그람음성 막대균(Glucose Non-Fermentative Gram negative bacilli, GNFB)
◈ 개요 310
I. Pseudomonas 속 311
1. 특징 및 감염경로 311
2. 병원성 313
3. 예방 313
4. 치료 313
5. 검사실 동정 시험 314
Ⅱ. Acinetobacter 속 316
1. 특징 및 감염경로 316
2. 병원성 316
3. 예방 317
4. 치료 317
5. 검사실 동정 시험 317
Ⅲ. Burkholderia cepacia 319
1. 특징 및 감염경로 319
2. 치료 319
3. 검사실 동정 시험 319
Ⅳ. Burkholderia pseudomallei 319
1. 특징 및 감염경로 319
2. 치료 320
3. 검사실 동정 시험 320
Ⅴ. Stenotrophomonas 320
1. 특징 및 감염경로 320
2. 치료 321
3. 검사실 동정 시험 321
Ⅵ. Alcaligenes 속 321
1. 특징 및 감염경로 321
2. 치료 321
3. 검사실 동정 시험 321
Ⅶ. Chryseobacterium 속 322
1. 특징 및 감염경로 322
2. 병원성 322
3. 치료 322
4. 검사실 동정 시험 322
Ⅷ. Chromobacterium violaceum 322
1. 특징 및 감염경로 322
2. 병원성 323
3. 치료 323
4. 검사실 동정 시험 323
Ⅸ. 기타 그람음성 알균, 쌍알균, 짧은 막대균의 동정 323
단원 요약 324
단원 핵심 문제 324

10장 영양조건이 까다로운 그람음성 막대균
◈ 개요 328
Ⅰ. Hemophilus 속 329
1. H. influenzae 329
2. H. parainfluenzae 334
3. H. aegyptius 334
4. H. ducreyi 335
Ⅱ. HACEK 그룹 336
치료 336
Ⅲ. Bordetella 속 337
1. 특징 및 감염경로 337
2. 병원성 337
3. 예방 338
4. 치료 338
5. 검사실 동정 시험 338
Ⅳ. Brucella 속 340
1. 특징 및 감염경로 340
2. 병원성 340
3. 예방 341
4. 치료 341
5. 검사실 동정 시험 341
Ⅴ. Francisella 속 341
1. 특징 및 감염경로 341
2. 병원성 342
3. 예방 342
4. 치료 343
5. 검사실 동정 시험 343
Ⅵ. Legionella 속 344
1. 특징 및 감염경로 344
2. 병원성 344
3. 예방 346
4. 치료 346
5. 검사실 동정 시험 346
Ⅶ. Eikenella corrodens 348
1. 특징 및 감염경로 348
2. 병원성 348
3. 치료 348
4. 검사실 동정 시험 348
Ⅷ. Cardiobacterium 속 349
1. 특징 및 감염경로 349
2. 병원성 349
3. 치료 349
4. 검사실 동정 시험 349
Ⅸ. Aggregatibacter (과거 명칭: Actinobacillus )속 349
1. 분류 349
2. 병원성 350
3. 치료 350
4. 검사실 동정 시험 350
Ⅹ. Kingella 속 350
1. 특징 및 감염경로 350
2. 병원성 350
3. 검사실 동정 시험 351
ⅩⅠ. Pasteurella 속 351
1. 특징 351
2. 병원성 352
3. 치료 352
4. 검사실 동정 시험 352
ⅩⅡ. Streptobacillus moniliformis 352
1. 특징 및 감염경로 352
2. 병원성 352
3. 치료 352
4. 검사실 동정 시험 352
ⅩⅢ. Bartonella 속 353
1. 특징 및 감염경로 353
2. 병원성 353
3. 치료 354
4. 검사실 동정 시험 354
ⅩⅣ. Afipia 속 354
ⅩⅤ. Capnocytophaga 속 354
1. 특징 및 감염경로 354
2. 병원성 355
3. 치료 355
4. 검사실 동정 시험 355
ⅩⅥ. Gardnerella vaginalis 356
단원 요약 357
단원 핵심 문제 358

11장 비브리오, 캄필로박터, 헬리코박터(Vibrio, Campylobacter, Helicobacter)
◈ 개요 362
Ⅰ. Vibrio 속 362
1. V. cholerae 362
2. Vibrio vulnificus 370
3. V. parahemolyticus 372
4. Vibrio alginplyticus 375
Ⅱ. Aeromonas 속 375
1. 특징 및 감염경로 375
2. 병원성 375
3. 치료 375
4. 검사실 동정 시험 375
Ⅲ. Plesiomonas shigelloides 376
1. 특징 및 감염경로 376
2. 병원성 377
3. 검사실 동정 시험 377
Ⅳ. Campylobacter 속 378
1. 특징 및 감염경로 378
2. 병원성 380
3. 예방 380
4. 치료 380
5. 검사실 동정 시험 380
6. 생화학적 시험 381
Ⅴ. Helicobacter 속 383
Helicobacter pylori 383
단원 요약 386
단원 핵심 문제 386

12장 나선균(Treponema , Borrelia 와 Leptospira)
◈ 개요 390
Ⅰ. Treponema 속 390
1. Treponema pallidum 391
2. Treponema carateum 397
3. Treponema pertenue 397
Ⅱ. Borrelia 속 398
1. B. recurrentis 398
2. B. burgdorferi 399
3. Borrelia anserina 400
4. 예방 400
5. 치료 400
6. 검사실 동정 시험 400
Ⅲ. Leptospira 속 400
1. 특징 및 감염경로 400
2. 병원성 401
3. 예방 401
4. 치료 401
5. 검사실 동정 시험 401
단원 요약 403
단원 핵심 문제 404

13장 리케치아, 클라미디아, 미코플라스마 및 L형
◈ 개요 408
Ⅰ. Chlamydia 속과 Chlamydophila 속 408
1. Chlamydia trachomatis 409
2. Chlamydophila psittaci 412
3. Chlamydophila pneumoniae 412
Ⅱ. Rickettsia 속 414
1. Orientia tsutsugamushi 414
2. Rickettsia prowazekii 416
3. Rickettsia typhi 417
4. Rickettsia rickettsii 417
Ⅲ. Coxiella 속 419
1. 특징 및 감염경로 419
2. 병원성 419
3. 예방 419
4. 치료 419
5. 검사실 동정 시험 419
Ⅳ. Ehrlichia 속과 Anaplasma 속 420
1. 특징 및 감염경로 420
2. 병원성 420
3. 예방 420
4. 치료 420
5. 검사실 동정 시험 420
Ⅴ. Mycoplasma 속 420
1. 특징 및 감염경로 421
2. 병원성 421
3. 치료 422
4. 검사실 동정 시험 422
Ⅵ. Ureaplasma 속 424
1. 특징 및 감염경로 424
2. 병원성 424
3. 치료 424
4. 검사실 동정 시험 425
Ⅶ. L형(L-form) 425
단원 요약 425
단원 핵심 문제 426

14장 무산소성 세균(Anaerobic Bacteria)
◈ 개요 430
Ⅰ. Clostridium 속 433
1. Clostridium perfringens 433
2. Clostridium tetani 437
3. Clostridium botulinum 441
4. C lostridioides difficile (과거 명칭: Clostridium difficile ) 443
Ⅱ. Cutibacterium (과거 명칭: Propionibacterium )속 444
Ⅲ. Bacteroides 속 445
1. 특징 및 감염경로 445
2. 병원성 445
3. 예방 445
4. 치료 445
Ⅳ. Fusobacterium 속 445
Ⅴ. Leptotrichia 속 447
단원 요약 448
단원 핵심 문제 448

15장 임상미생물의 검체별 배양검사
◈ 개요 454
Ⅰ. 혈액배양 455
1. 채혈 455
2. 혈액배양용 배지 457
3. 혈액배양의 진행 457
Ⅱ. 뇌척수액 배양 459
1. 검체 채취 및 운송 459
2. 배양 461
3. 예비동정 462
4. 항생제 감수성 검사 462
Ⅲ. 오줌배양 463
1. 검체 채취 463
2. 배양과 해석 464
3. 스크리닝 검사 465
4. 정량배양 및 추정 동정 465
5. 검사실 동정 시험 467
6. 항생제 감수성 검사 467
Ⅳ. 대변배양 467
1. 설사의 병원체와 임상적 특징 467
2. 대변 검체의 채취 및 운송 469
3. 대변검체의 증균배양 470
4. 장내 병원균 배양을 위한 선택배지 470
5. 분리배양 471
6. 분리균주의 예비 동정 472
7. 최종 미생물학적 동정 477
8. 혈청학적 동정 시험 480
Ⅴ. 상부 호흡기 검체 배양 482
1. 인두의 정상 정상균무리 482
2. 인두염의 병원체 482
3. 검체 채취 및 운송 484
4. 배양과 동정 484
5. 항생제 감수성 시험 485
Ⅵ. 하부 호흡기 검체 배양 486
1. 급성 및 만성 기관지염 486
2. 폐 농양 486
3. 폐렴 및 기관지폐렴 486
4. 폐결핵 486
Ⅶ. 생식기계통 검체 배양 490
1. 남성의 요도염 491
2. 여성의 생식기 검체 493
3. 생식기 궤양 검체 배양 494
Ⅷ. 고름, 상처 배양 497
1. 수술부위 검체 497
2. 개방성 창상 499
3. 병원감염 창상 499
4. 검체 채취 및 수송 499
Ⅸ. 열상, 창상감염, 수술 후 상처, 화상 및 욕창 배양 500
1. 코곁굴염 또는 림프절 배액 500
2. 삼출액 500
3. 육안적 평가 500
Ⅹ . 불명 검체의 동정 시험(Unknown specimen identification) 507
1. 검체 사례 ① - 가래 507
2. 검체 사례 ② - 가래 507
3. 검체 사례 ③ - 가래 508
4. 검체 사례 ④ - 창상 검체 508
5. 검체 사례 ⑤ - 오줌 검체 509
6. 검체 사례 ⑥ - 오줌 검체 510
단원 요약 511
단원 핵심 문제 515

3부 의학진균학, 의학바이러스학, 의학기생충학 521

16장 의학진균학
◈ 개요 524
I. 진균의 생식 524
1. 유성생식포자 524
2. 무성생식포자 524
II. 진균의 분류와 동정진단 524
1. 효모 525
2. 사상균 529
3. 두 형태 진균 532
III. 항진균제 535
1. 아졸계 항진균제 535
2. 그리세오풀빈 535
3. 암포테리신 B 535
4. 에키노칸딘 항진균제 537
5. 카스포펀진 537
6. 항균제 감수성 검사 538
단원 요약 538
단원 핵심 문제 539

17장 의학바이러스학
I. 바이러스의 분류와 증식 542
1. 바이러스의 분류 542
2. 바이러스의 증식 543
3. 바이러스 감염병의 진단 544
4. 검체의 채취 시기 546
5. 검체의 보존·수송 546
II. 외피비보유 DNA 바이러스 547
1. Adenovirus 547
2. Papillomavirus 547
III. 외피보유 DNA 바이러스 548
1. Herpes Simplex virus(type 1) 548
2. Herpes Simplex virus(type 2) 549
3. Varicella-Zoster virus(VZV) 550
4. Cytomegalovirus(CMV) 551
5. Epstein-Barr virus(EBV) 551
6. Hepatitis B virus 552
7. Smallpox virus 552
IV. 외피비보유 RNA 바이러스 553
1. Astrovirus 553
2. Poliovirus 554
3. Coxsackievirus 555
4. Hepatitis A virus 556
5. Reovirus(Rotavirus) 556
6. Rhinovirus 556
V. 외피보유 RNA 바이러스(표 17.3) 557
1. Influenza virus 557
2. Parainfluenza virus 559
3. Measles virus 559
4. Rubella virus 560
5. Respiratory syncytial virus(RS virus) 560
6. Rabies virus 561
7. Human Immunodeficiency virus(HIV) 562
8. Coronavirus 564
단원 요약 566
단원 핵심 문제 566

18장 의학기생충학
◈ 개요 570
I. 원생동물 570
1. 근족충류 571
2. 섬모충류 571
3. 포자충류 571
4. 편모충류 574
II. 후생동물(연충류, 윤충류) 575
1. 선충류 575
2. 조충류 579
3. 흡충류 581
단원 요약 583
단원 핵심 문제 586

참고문헌 588
찾아보기 590