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책 정보
· 분류 : 국내도서 > 컴퓨터/모바일 > 프로그래밍 언어 > Perl/CGI
· ISBN : 9788979141801
· 쪽수 : 509쪽
· 출판일 : 2002-03-19
책 소개
목차
1장. 생물학과 전산학
DNA의 구조
단백질의 구조
인 실리코
컴퓨터 사용의 한계
2장. 펄 시작하기
쉽지만 오래 공부해야할 언어
펄의 장점
펄 설치
펄 프로그램 실행 방법
문서 편집기
도움말 찾기
3장. 프로그래밍 기술
프로그래밍, 무엇부터 시작할까
편집, 실행, 수정, 저장
프로그래밍 환경
프로그래밍 전략
프로그래밍 과정
4장. 서열과 문자열
서열 데이터의 표현
DNA 서열 저장을 위한 프로그램
DNA 조각 연결
전사 : DNA를 RNA로
펄 문서의 사용
펄의 역상보 계산
단백질, 파일, 배열
파일에서의 단백질 해석
배열
스칼라 문맥과 리스트 문맥
연습문제
5장. 모티프와 루프
제어 흐름
코드 배치
모티프 탐색
뉴클리오타이드 개수 세기
문자열을 배열로 분해하기
문자열에서의 연산
파일에 쓰기
연습문제
6장. 서브루틴과 버그
서브루틴
스코핑과 서브루틴
명령어 라인 인자와 배열
데이터를 서브루틴으로 보내기
서브루틴 모듈과 라이브러리
코드의 버그 수정
연습문제
7장. 변이와 임의화
임의수 생성기
임의화를 사용한 프로그램
DNA 변이 모의실험 프로그램
임의의 DNA 생성하기
DNA 분석
연습문제
8장. 유전자 코드
해시
생물학을 위한 데이터 구조와 알고리즘
유전자 코드
DNA를 단백질로 번역하기
FASTA 포맷 파일에서 DNA 데이터 읽기
리딩 프레임
연습문제
9장. 제한 지도와 정규 표현식
정규 표현식
제한 지도와 제한 효소
펄 연산자
연습문제
10장. GenBank
GenBank 파일
GenBank 라이브러리
서열과 주석 분리하기
주석 파싱하기
DBM을 이용한 GenBank 인덱싱
연습문제
11장. 단백질 데이터 뱅크
PDB 개요
파일과 폴더
PDB 파일
PDB 파일 파싱
다른 프로그램 제어
연습문제
12장. BLAST
BLAST 구하기
문자열 매칭과 상동성
BLAST 출력 파일
BLAST 출력 파싱
데이터 표현
바이오펄
연습문제
13장. 그 밖의 논제
프로그램 디자인 기술
웹 프로그래밍
알고리즘과 서열 정렬
객체 지향 프로그래밍
펄 모듈
복합 데이터 구조
관계형 데이터베이스
마이크로어레이와 XML
그래픽 프로그래밍
네트워크 모델링
DNA 컴퓨터
부록 A. 리소스
부록 B. 펄 요약
