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책 정보
· 분류 : 국내도서 > 컴퓨터/모바일 > 컴퓨터 공학 > 데이터베이스 개론
· ISBN : 9791162240748
· 쪽수 : 304쪽
책 소개
목차
CHAPTER 0 들어가며
0.1 왜 ‘사이파이’인가?
0.2 사이파이 생태계
0.3 대혼란 : 파이썬 2 vs 파이썬 3
0.4 사이파이 생태계와 커뮤니티
0.5 도움받기
0.6 파이썬 설치하기
0.7 사이파이의 세계로
CHAPTER 1 우아한 넘파이 : 파이썬 과학 기초
1.1 유전자 발현 데이터
1.2 넘파이 N차원 배열
__1.2.1 왜 파이썬 리스트 대신 ndarray를 사용할까?
__1.2.2 벡터화
__1.2.3 브로드캐스팅
1.3 유전자 발현 데이터셋
__1.3.1 팬더스로 데이터 읽기
1.4 정규화
__1.4.1 샘플 간 비교
__1.4.2 샘플 간 공간 크기 정규화
__1.4.3 유전자 간 비교
__1.4.4 샘플과 유전자의 정규화 : RPKM
1.5 정리
CHAPTER 2 넘파이와 사이파이의 분위수 정규화
2.1 데이터 가져오기
2.2 개체 간 유전자 발현 분포의 차이
2.3 이중 군집화
2.4 군집 시각화
2.5 생존율 예측
__2.5.1 추가 작업 : TCGA의 환자 군집 사용하기
__2.5.2 추가 작업 : TCGA 군집 재현하기
CHAPTER 3 이미지 지역망 : ndimage
3.1 이미지는 넘파이 배열일 뿐이다
__3.1.1 연습문제 : 격자 오버레이 추가
3.2 신호 처리 필터
3.3 이미지 필터링(2차원 필터)
3.4 제네릭 필터 : 근접값의 임의 함수
__3.4.1 연습문제 : 콘웨이의 생명 게임
__3.4.2 연습문제 : 소벨 필터 코드 리팩토링
3.5 그래프와 NetworkX 라이브러리
__3.5.1 연습문제 : 사이파이 곡선 맞춤
3.6 지역 근접 그래프
3.7 우아한 ndimage : 지역 근접 그래프에서 호랑이 추출하기
3.8 평균 색상 분할
CHAPTER 4 주파수와 고속 푸리에 변환
4.1 주파수
4.2 새소리 스펙트로그램
4.3 푸리에 변환 역사
4.4 푸리에 변환 구현
4.5 이산 푸리에 변환 길이 선택하기
4.6 기타 이산 푸리에 변환 개념
__4.6.1 주파수와 순서
__4.6.2 윈도윙
4.7 실전 레이더 데이터 분석
__4.7.1 주파수 영역의 신호 속성
__4.7.2 윈도우 적용하기
__4.7.3 레이더 이미지
__4.7.4 기타 고속 푸리에 변환 응용
__4.7.5 기타 참고 자료
__4.7.6 연습문제 : 이미지 합성곱
CHAPTER 5 희소행렬과 혼동행렬
5.1 혼동행렬
__5.1.1 연습문제 : 혼동행렬의 계산 복잡성
__5.1.2 연습문제 : 혼동행렬을 계산하는 대체 알고리즘
__5.1.3 연습문제 : 다중 혼동행렬 계산
5.2 scipy.sparse 데이터 형식
__5.2.1 COO 형식
__5.2.2 연습문제 : COO 형식 표현
__5.2.3 CSR 형식
5.3 희소행렬 애플리케이션 : 이미지 변환
__5.3.1 연습문제 : 이미지 회전
5.4 (다시) 혼동행렬
__5.4.1 연습문제 : 메모리 사용량 줄이기
5.5 분할과 혼동행렬
5.6 정보 이론 요약
__5.6.1 연습문제 : 조건부 엔트로피 계산
5.7 분할의 정보 이론 : 정보 변형
5.8 희소행렬을 위한 넘파이 배열
5.9 정보 변형 사용하기
CHAPTER 6 사이파이 선형대수학
6.1 선형대수학 기초
6.2 그래프의 라플라시안 행렬
__6.2.1 연습문제 : 회전 행렬
6.3 뇌 데이터와 라플라시안
__6.3.1 연습문제 : 유사도 보기
__6.3.2 도전 과제 : 희소행렬과 선형대수학
6.4 페이지랭크 알고리즘 : 평판과 중요도를 위한 선형대수학
__6.4.1 연습문제 : 댕글링(Dangling) 노드 처리
__6.4.2 연습문제 : 함수 비교
6.5 마치며
CHAPTER 7 사이파이 함수 최적화
7.1 사이파이 최적화 모듈 : scipy.optimize
__7.1.1 예제 : 이미지 이동 최적화 계산
7.2 이미지 등록 최적화
7.3 국소 최저치 피하기와 배싱 호핑
__7.3.1 연습문제 : 정렬 함수 수정
7.4 무엇이 최선인가? : 적합한 목적함수 선택
CHAPTER 8 빅데이터와 Toolz 라이브러리
8.1 스트리밍과 yield
8.2 Toolz 스트리밍 라이브러리 소개
8.3 k-mer 계산과 오류 수정
8.4 커링 : 스트리밍의 묘미
8.5 k-mer 계산 계속하기
__8.5.1 연습문제 : 스트리밍 데이터와 PCA
8.6 게놈의 마르코프 모델
__8.6.1 연습문제 : 온라인 압축풀기
에필로그
부록 : 연습문제 정답