바이오 코딩

들어가기에 앞서 17

책의 구조 21

1부. 단 이틀 만에 코로나 백신을 설계한 모더나

1. 바이오 코더의 등장 29
1) 바이오 코더(Bio Coder)
2) 의약품의 특허와 선점
3) 권리의 독점을 막기 위해

2. 바이오 윤리에 대하여 37
1) 영웅이 되고 싶었던 한 과학자
2) 유전공학은 신을 흉내 내는 일인가?
3) 바이오 코더가 유명해진 계기: 본인 몸에 실험
4) 1경 원 이상 필요한 유전자 치료 비용
5) 임상 시험에서 전문 연구자가 한 말

3. 과학의 본래 의미 51
1) 과학은 신뢰나 혁명의 대상이 아닙니다.
2) 에키네시아(Echinacea)
3) 과학적이라는 말과 장 보드리아르의 대체물(Simulacre)
4. 바이오 코더가 하는 일의 안전성과 오픈소스 운동 58

2부. 초등학생도 할 수 있는 유전자 조작
65
1) 실험 준비
2) Cas9과 gRNA를 준비하고 결합합니다.
3) Cas9/gRNA 덩어리가 목표 DNA의 gRNA 서열과 일치하는 곳에 결합합니다.
4) Cas9이 우리가 원하는 DNA 서열을 자릅니다.
5) 세포 스스로 재생하며 유전자를 교체합니다.
6) 세포는 임의로 편집한 유전자를 갖습니다.

3부. 세포와 생명, 그리고 유전자

1. 기본 원리 91
1) 센트럴 도그마(Central Dogma)
2) 세포의 보편적인 특징
3) 생명의 종류와 진화

2. 전사(Transcription): DNA가 RNA로 102
1) DNA 일부가 RNA로 전사됩니다. RNA가 DNA로 역전사되기도 합니다.
2) RNA 전사를 시작하는 위치, 멈추는 위치
3) 박테리아의 RNA 전사
4) 진핵생물의 RNA 전사
5) RNA 중합체 II
6) 전사가 진행될수록 변하는 DNA 구조
7) 진핵세포는 RNA 후공정을 진행합니다.
8) mRNA는 선택과정을 거칩니다.
9) 번역되지 않는 RNA

3. 번역(Translation): RNA가 단백질로 124
1) 번역의 공통 언어 코돈(Codon)
2) tRNA
3) 번역 오류를 줄이는 리보솜과 연장 인자
4) 단백질 합성의 시작과 끝
5) 단백질 손상 수리

4. RNA에 관하여 136

5. 단백질에 관하여 138
1) 단백질의 구조
2) 단백질의 기능

6. 유전자 발현의 조절에 관하여 149
: 전사조절, 가공조절, 선택조절, RNA 활성조절, 번역조절, 단백질 활성조절

7. 생명공학의 과제 153

4부. 본격적인 바이오 코딩 실험

1. 단백질과 유전자 라이브러리로 실험 대상 정하기 159

2. 유당불내증(Lactose Intolerance) 완치 실험 165
1) 실험 개요
2) 세포 배양
3) 결과 확인 및 정제

3. 코로나바이러스 DNA 백신 제조 실험 180
1) 실험 개요
2) 스파이크 단백질(Spike protein) 최적화
3) 세포 배양
4) 엘라이자(ELISA)로 발현 확인

4. 딥러닝을 이용한 대변 이식 IBS 완치 실험, 체중감량 실험 198
1) 실험 개요
2) 16S rRNA와 미생물 분석 원리
3) 미생물 분석을 위한 QIIME2 설치
4) QIMME2를 이용한 미생물 딥러닝 분석

5부. 3세대 크리스퍼 가위, 4세대 프라임 에디터

1. 3세대 유전자 가위 크리스퍼 229
1) 개요
2) 실험 1. 박테리아 대상 실험(2012년)
3) 실험 2. 진핵생물 실험(2013년)

2. 4세대 유전자 가위 프라임 에디터 257
1) 개요
2) 실험. 프라임 에디터(2019년)

6부. 더 읽을거리 285

7부. 후기 295